俗稱：沙腸仔
分佈：大甲溪口
特性：身體細長呈圓桶狀，背鰭有黑色斑點，可長達10~15cm。肉食性，補食甲殼類及多毛類。夏季產卵於溪流河口一帶沙中。

俗稱：河豚
分佈：河口
特性：背部灰青色，有顯著的淡黃斑點散布，具有潛藏在沙中的特性，離開水面時，腹部會充氣而顯得圓滾滾的。肝臟和卵槽有劇毒，不可誤食。最大可長至10~15cm。生活於砂質底的河口區，而在每年5~8月會大群湧到小砂粒底質的岸邊產卵。

分佈：德基、青山、谷關、白冷
特性：口裂很大，有一小脂鰭。秋冬產卵，產卵後親魚即死亡，卵孵化後順流游至河口，以浮游生物為食；次年春再上溯至河川中游，雜食、群居；最大可至15~30cm。本流域現有之香魚為自日本引進之陸封型香魚，30多年前大甲溪中游東勢以下曾生活著台灣原產的香魚，但現在已經絕跡。而放流的日本香魚，族群頗大，原只分佈於德基青山段，近年已往下延伸至白冷和橫流溪附近，釣客常在此釣獲大香魚。

俗稱：棕簑貼仔、簑衣貼仔、木箕貼仔、簸箕魚
分佈：白冷至石岡壩（保育種魚類）
特性：棲息於水流較大而湍急的溪流，能平貼在石頭上，經常在石頭間跑來跑去，以青苔、藻類為食，是台灣特有種，在大甲溪數量不多，但在濁水溪是優勢種。本種為台灣生物地理區「南區」的生物代表之一。

俗稱：三角姑、淡水河鮠、長鰭鮠
分佈：谷關至甲南一帶
特性：有鬚4對，無鱗，體側中央有一平直側線，有一脂鰭，體背部黃綠色，受驚嚇會變灰褐色。肉食性，凶猛、夜行性，棲息於底層水域最大可長至15~20cm。脂鮠為底棲性魚類，棲息於巨石後方或附近石縫中，晝伏夜出。常與石斑、褐吻蝦虎、粗首
獵*(魚字旁)等混居生活。背鰭和胸鰭共有三根硬刺，是厲害的防身武器。

俗稱：牛屎鯽、紅目[魚代]仔、橘魚
分佈：大茅埔至梅子一帶
特性：體型小，很美麗。雌魚將卵產於田蚌等二枚貝的鰓瓣上，與之共生。雄魚體色鮮豔，尾鰭中央有紅色縱紋，基部有一條藍色縱帶，背部豔藍有金屬光澤，為淡水魚中少數美麗的種類之一。

俗稱：溪哥仔、紅貓、闊嘴狼、苦槽仔
分佈：谷關至溪口
特性：喜歡生活在高溶氧量的溪流，幼魚雜食性，成魚趨向肉食性，黃昏及清晨常躍出水面補食補食水面活動或落水的昆蟲。

俗稱：船釘仔、短吻棒花魚
分佈：白冷至圳堵之間
特性：底棲性，以刮食藻類為主。從前數量頗多，近年其族群有減少的趨勢。棲息於清澈溪流之溪流底層石礫上活動。